MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 3298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	TATTT	2	10	1444	1453	20 %	80 %	0 %	0 %	203288507
2	NC_011247	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
3	NC_011247	CATA	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	203288507
4	NC_011247	T	7	7	1531	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
5	NC_011247	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
6	NC_011247	ATC	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
7	NC_011247	AAT	2	6	1630	1635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
8	NC_011247	TCA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
9	NC_011247	AT	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
10	NC_011247	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
11	NC_011247	TTG	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
12	NC_011247	AT	3	6	1726	1731	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
13	NC_011247	ATA	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
14	NC_011247	T	6	6	1783	1788	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
15	NC_011247	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
16	NC_011247	CTT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
17	NC_011247	TAG	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288507
18	NC_011247	CAAAT	2	10	2000	2009	60 %	20 %	0 %	20 %	203288507
19	NC_011247	ATT	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288507
20	NC_011247	TAA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
21	NC_011247	CTT	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
22	NC_011247	TTG	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
23	NC_011247	TTG	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
24	NC_011247	TTTTG	2	10	2172	2181	0 %	80 %	20 %	0 %	203288507
25	NC_011247	TTC	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
26	NC_011247	TTCTT	3	15	2194	2208	0 %	80 %	0 %	20 %	203288507
27	NC_011247	TCT	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
28	NC_011247	AGTT	2	8	2252	2259	25 %	50 %	25 %	0 %	203288507
29	NC_011247	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
30	NC_011247	TCAC	2	8	2355	2362	25 %	25 %	0 %	50 %	203288507
31	NC_011247	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
32	NC_011247	TC	3	6	2407	2412	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
33	NC_011247	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
34	NC_011247	ATA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
35	NC_011247	AT	3	6	2699	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
36	NC_011247	ATTT	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	203288508
37	NC_011247	TTCA	2	8	2779	2786	25 %	50 %	0 %	25 %	203288508
38	NC_011247	AAT	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
39	NC_011247	T	6	6	2832	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	203288508
40	NC_011247	ATA	3	9	2914	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
41	NC_011247	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
42	NC_011247	T	6	6	2981	2986	0 %	100 %	0 %	0 %	203288508
43	NC_011247	AATG	2	8	2987	2994	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
44	NC_011247	AGTA	2	8	3041	3048	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
45	NC_011247	TCT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
46	NC_011247	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
47	NC_011247	ATC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288508
48	NC_011247	TCT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
49	NC_011247	ATC	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288508
50	NC_011247	TA	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
51	NC_011247	TAA	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
52	NC_011247	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
53	NC_011247	TTCTC	2	10	3284	3293	0 %	60 %	0 %	40 %	203288508
54	NC_011247	TTG	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288508
55	NC_011247	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288508
56	NC_011247	TCT	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
57	NC_011247	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
58	NC_011247	TTCTGC	2	12	3448	3459	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288508
59	NC_011247	TAT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
60	NC_011247	CTC	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288508
61	NC_011247	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
62	NC_011247	TAA	2	6	3603	3608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
63	NC_011247	ATA	2	6	3626	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
64	NC_011247	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
65	NC_011247	GTC	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288509
66	NC_011247	T	6	6	3861	3866	0 %	100 %	0 %	0 %	203288509
67	NC_011247	TCT	2	6	3869	3874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
68	NC_011247	CTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
69	NC_011247	T	6	6	3918	3923	0 %	100 %	0 %	0 %	203288509
70	NC_011247	CT	3	6	3931	3936	0 %	50 %	0 %	50 %	203288509
71	NC_011247	TTC	2	6	3946	3951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
72	NC_011247	TTA	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288509
73	NC_011247	TAATA	2	10	4027	4036	60 %	40 %	0 %	0 %	203288509
74	NC_011247	TAG	2	6	4284	4289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288510
75	NC_011247	CTT	2	6	4304	4309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
76	NC_011247	T	7	7	4312	4318	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
77	NC_011247	ATC	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
78	NC_011247	CTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
79	NC_011247	CAT	2	6	4432	4437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
80	NC_011247	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
81	NC_011247	ATA	2	6	4586	4591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
82	NC_011247	TA	3	6	4622	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	203288510
83	NC_011247	T	9	9	4630	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
84	NC_011247	TCA	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
85	NC_011247	GAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288510
86	NC_011247	ATC	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
87	NC_011247	TTCT	2	8	4763	4770	0 %	75 %	0 %	25 %	203288510
88	NC_011247	CAA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288510
89	NC_011247	TAT	2	6	4913	4918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288510
90	NC_011247	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	203288510
91	NC_011247	AAT	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
92	NC_011247	T	9	9	4983	4991	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
93	NC_011247	TTTCTT	2	12	5038	5049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288510
94	NC_011247	TCT	2	6	5061	5066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
95	NC_011247	CAT	2	6	5128	5133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
96	NC_011247	ATC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
97	NC_011247	AGA	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288510
98	NC_011247	CAG	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
99	NC_011247	AGC	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
100	NC_011247	AGC	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
101	NC_011247	AGGAGC	2	12	5210	5221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288510
102	NC_011247	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288510
103	NC_011247	T	6	6	5285	5290	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
104	NC_011247	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
105	NC_011247	T	8	8	5343	5350	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
106	NC_011247	TTA	2	6	5377	5382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288510
107	NC_011247	CAT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
108	NC_011247	GTC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288511
109	NC_011247	CTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
110	NC_011247	TTG	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288511
111	NC_011247	CTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
112	NC_011247	CAATT	2	10	5876	5885	40 %	40 %	0 %	20 %	203288511
113	NC_011247	TCT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
114	NC_011247	TAA	2	6	5957	5962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288511
115	NC_011247	ATA	2	6	5981	5986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288511
116	NC_011247	TAT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288511
117	NC_011247	CAA	2	6	6044	6049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288511
118	NC_011247	TCA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
119	NC_011247	GAT	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288511
120	NC_011247	CAT	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
121	NC_011247	ATC	2	6	6128	6133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
122	NC_011247	TTCT	2	8	6158	6165	0 %	75 %	0 %	25 %	203288511
123	NC_011247	CTT	3	9	6187	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
124	NC_011247	CAT	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
125	NC_011247	AG	3	6	6260	6265	50 %	0 %	50 %	0 %	203288511
126	NC_011247	A	7	7	6308	6314	100 %	0 %	0 %	0 %	203288511
127	NC_011247	A	6	6	6333	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	203288511
128	NC_011247	CAAT	2	8	6358	6365	50 %	25 %	0 %	25 %	203288511
129	NC_011247	TTTCTT	2	12	6451	6462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288511
130	NC_011247	TCT	2	6	6474	6479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
131	NC_011247	TCA	4	12	6522	6533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
132	NC_011247	CAA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288511
133	NC_011247	CAG	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288511
134	NC_011247	ATG	2	6	6601	6606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288511
135	NC_011247	T	6	6	6608	6613	0 %	100 %	0 %	0 %	203288511
136	NC_011247	T	8	8	6666	6673	0 %	100 %	0 %	0 %	203288511
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265	NC_011247	TGT	2	6	12240	12245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288516
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267	NC_011247	CAT	2	6	12343	12348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288516
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270	NC_011247	TAA	2	6	12463	12468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288516
271	NC_011247	TCT	2	6	12503	12508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288516
272	NC_011247	TGCTT	2	10	12512	12521	0 %	60 %	20 %	20 %	203288516
273	NC_011247	CAT	2	6	12547	12552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288516
274	NC_011247	TA	3	6	12553	12558	50 %	50 %	0 %	0 %	203288516
275	NC_011247	ATCT	2	8	12571	12578	25 %	50 %	0 %	25 %	203288516
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277	NC_011247	ATTG	2	8	12613	12620	25 %	50 %	25 %	0 %	203288516
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283	NC_011247	TAAA	2	8	12928	12935	75 %	25 %	0 %	0 %	203288516
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287	NC_011247	T	6	6	13294	13299	0 %	100 %	0 %	0 %	203288517
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392	NC_011247	TTTA	2	8	18157	18164	25 %	75 %	0 %	0 %	203288521
393	NC_011247	CAT	2	6	18180	18185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288521
394	NC_011247	TA	3	6	18193	18198	50 %	50 %	0 %	0 %	203288521
395	NC_011247	CCT	2	6	18214	18219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288521
396	NC_011247	T	7	7	18222	18228	0 %	100 %	0 %	0 %	203288521
397	NC_011247	TTA	2	6	18275	18280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288521
398	NC_011247	TCA	3	9	18308	18316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288521
399	NC_011247	TCT	2	6	18340	18345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288521
400	NC_011247	TGC	2	6	18346	18351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288521
401	NC_011247	GCA	2	6	18362	18367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288521
402	NC_011247	CAT	2	6	18387	18392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288521
403	NC_011247	ATA	2	6	18393	18398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288521
404	NC_011247	AAT	2	6	18437	18442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288521
405	NC_011247	TAT	2	6	18492	18497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288521
406	NC_011247	TCT	2	6	18557	18562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288521
407	NC_011247	TGT	2	6	18569	18574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288521
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411	NC_011247	ATA	2	6	18656	18661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288521
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415	NC_011247	TCT	2	6	18963	18968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288522
416	NC_011247	TAC	2	6	18999	19004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288522
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420	NC_011247	TA	3	6	19128	19133	50 %	50 %	0 %	0 %	203288522
421	NC_011247	GCA	2	6	19144	19149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288522
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423	NC_011247	GTAA	2	8	19195	19202	50 %	25 %	25 %	0 %	203288522
424	NC_011247	AATT	2	8	19215	19222	50 %	50 %	0 %	0 %	203288522
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431	NC_011247	T	6	6	19458	19463	0 %	100 %	0 %	0 %	203288522
432	NC_011247	TTCT	2	8	19499	19506	0 %	75 %	0 %	25 %	203288522
433	NC_011247	CTT	3	9	19517	19525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288522
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440	NC_011247	ATTAAC	2	12	19759	19770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288523
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453	NC_011247	A	7	7	20228	20234	100 %	0 %	0 %	0 %	203288523
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494	NC_011247	TA	3	6	22089	22094	50 %	50 %	0 %	0 %	203288526
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496	NC_011247	AAT	3	9	22220	22228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288526
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